48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1296 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  92.31 
 
 
286 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  78.14 
 
 
247 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  43.89 
 
 
281 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  38.43 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  36.86 
 
 
263 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  44.85 
 
 
283 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  36.86 
 
 
263 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  37.25 
 
 
263 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  36.08 
 
 
262 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
264 aa  175  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  36.08 
 
 
262 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  36.47 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  37.4 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  36.9 
 
 
261 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  37.3 
 
 
262 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  42.44 
 
 
238 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  39.34 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 
255 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 
273 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  34.02 
 
 
257 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  40.83 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  42.21 
 
 
291 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  42.4 
 
 
254 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  39.38 
 
 
324 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  42.62 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  37.45 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
265 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  40.24 
 
 
243 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  43.88 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  37.64 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  36.02 
 
 
256 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  35.47 
 
 
277 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  37.66 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  43.61 
 
 
140 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 
279 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  38.73 
 
 
253 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  31.65 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  43.2 
 
 
219 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  31.84 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  35.48 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  35.48 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1580  Putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  27.37 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  hitchhiker  9.565629999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  30.38 
 
 
335 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>