50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5377 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
265 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  45.35 
 
 
261 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  43.68 
 
 
257 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  43.02 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  45.6 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  45.67 
 
 
324 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  41.83 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  31.78 
 
 
263 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  31.09 
 
 
262 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  31.09 
 
 
262 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  31.76 
 
 
264 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  30.62 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  29.43 
 
 
263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  30.8 
 
 
263 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  30.86 
 
 
263 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  29.96 
 
 
263 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
238 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  48.21 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  34.16 
 
 
251 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
252 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  27.88 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  35.9 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  33.88 
 
 
257 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  32.14 
 
 
268 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  31.45 
 
 
264 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  27.89 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  28.68 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  31.67 
 
 
291 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  28.52 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  26.72 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  27.06 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  28.24 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  31.39 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  27.74 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1211  trifolitoxin immunity domain protein  29.41 
 
 
93 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.07 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13550  aminoglycoside phosphotransferase  42.5 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.669259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.04 
 
 
448 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.07 
 
 
448 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.266165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>