44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1984 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  100 
 
 
291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  47.64 
 
 
283 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  43.16 
 
 
247 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  43.9 
 
 
286 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  42.31 
 
 
295 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  39.11 
 
 
266 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  40.65 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  35.34 
 
 
279 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  35.98 
 
 
281 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  37.89 
 
 
264 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 
259 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  26.77 
 
 
264 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 
273 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  28.72 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  34.01 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  28.52 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  27.76 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  27.76 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  32.5 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  27.65 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  28.14 
 
 
262 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  28.14 
 
 
262 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  38.94 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  26.62 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  29.96 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  31.02 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  32.71 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  35.15 
 
 
251 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  33.2 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  27.42 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  30.83 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  33.08 
 
 
140 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  35.8 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  27.69 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>