14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1014 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1014  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  213  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  60.78 
 
 		 482 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  60.78 
 
 		 482 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  60.78 
 
 		 482 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  56.6 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  56.6 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4617  TnpC protein  61.7 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  58 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2716  hypothetical protein  55.77 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.909313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  54.55 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  54.55 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  54.55 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  47.92 
 
 		 456 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  47.92 
 
 		 457 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>