22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0682 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0682  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3057  phosphopantetheine-binding  55.13 
 
 		 82 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245048  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7015  phosphopantetheine-binding  47.37 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2776  hypothetical protein  35.06 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0180647  decreased coverage  0.000606651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4125  acyl carrier protein  29.87 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276699  normal  0.797115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1076  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0165  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0184  phosphopantetheine-binding  35.48 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4169  phosphopantetheine-binding  37.14 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0958  KR domain protein  32.69 
 
 		 2134 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3796  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0022968  normal  0.531414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1719  acyl carrier protein  32.76 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2687  phosphopantetheine-binding  32 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0061  phosphopantetheine-binding protein  36 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4214  acyl carrier protein  38 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3303  acyl carrier protein  38 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4111  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0894098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2518  phosphopantetheine-binding  42.22 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3637  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4152  acyl carrier protein  38 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.43157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1576  phosphopantetheine-binding protein  32.76 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1804  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 83 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>