15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0363 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0363  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  83.05 
 
 		 70 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  67.86 
 
 		 81 aa  84.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  75 
 
 		 73 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  63.93 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  75 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  64.91 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  60.42 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  68.89 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1721  hypothetical protein  38.3 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.468781  normal  0.898434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  38.46 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0865  regulatory protein, FmdB family  37.5 
 
 		 61 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000475517  normal  0.391737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  39.22 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  39.71 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>