18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0352 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  90.09 
 
 		 215 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  55.34 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  48.33 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  46.19 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  43.75 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.67 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.29 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  39.81 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.41 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  32.69 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.92 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.13 
 
 		 330 aa  62  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.83 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.14 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  25.89 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.02 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 		 237 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>