19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0295 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  501  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  82.31 
 
 		 262 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  34.41 
 
 		 248 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  31.67 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  33.06 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  32.6 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  32.17 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  27.31 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  29.8 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  30.17 
 
 		 439 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  36.11 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  28.02 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  30.51 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  31.4 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  30.42 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  26.29 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  26.85 
 
 		 583 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  35.16 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  39.71 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>