41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1633 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  100 
 
 
406 aa  811    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  24.03 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  21.56 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  24.52 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  24.1 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  23.44 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  22.47 
 
 
481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  24.38 
 
 
474 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  22.42 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  22.28 
 
 
481 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  22.28 
 
 
481 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  22.89 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  22.57 
 
 
474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  22.52 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  22.5 
 
 
474 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  22 
 
 
474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  21.16 
 
 
474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  24.43 
 
 
461 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  22.92 
 
 
409 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  22.19 
 
 
475 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  20.9 
 
 
417 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  21.56 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  21.49 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  22.39 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  20.89 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  24.29 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  23.73 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  21.97 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  24.02 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1823  glutaredoxin 1  35.14 
 
 
90 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1364  glutaredoxin 1  31.65 
 
 
89 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1954  glutaredoxin 1  32.56 
 
 
88 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0676431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2291  glutaredoxin, GrxA family  37.14 
 
 
87 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1688  glutaredoxin 1  32.56 
 
 
88 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2483  glutaredoxin 1  34.29 
 
 
85 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0921  glutaredoxin 1  34.29 
 
 
85 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00854  glutaredoxin 1, redox coenzyme for ribonucleotide reductase (RNR1a)  34.29 
 
 
85 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00860  hypothetical protein  34.29 
 
 
85 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2793  glutaredoxin, GrxA family  34.29 
 
 
85 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.719147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0876  glutaredoxin 1  34.29 
 
 
85 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1003  glutaredoxin 1  34.29 
 
 
85 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.288339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>