49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0878 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0878  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2816  cell wall hydrolase/autolysin  68.98 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.812888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3885  cell wall hydrolase/autolysin  32.99 
 
 
248 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1278  cell wall hydrolase/autolysin  32.49 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1766  cell wall hydrolase/autolysin  30.61 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000016158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  29.94 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1702  cell wall hydrolase/autolysin  32.05 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2195  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.95 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2277  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.95 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2237  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.95 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0334199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  38.95 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2446  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.95 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1724  cell wall hydrolase/autolysin  36.75 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0475505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1651  cell wall hydrolase/autolysin  32.08 
 
 
1504 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  27.18 
 
 
438 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  29.56 
 
 
703 aa  55.1  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.63 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2834  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.63 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2849  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.63 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000907792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2870  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.63 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00570311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 
657 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  28.7 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.44 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.04 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  28.12 
 
 
381 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 
529 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 
529 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 
529 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 
529 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.84 
 
 
529 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  37.11 
 
 
282 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0645  cell wall hydrolase/autolysin  28.74 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1350  cell wall hydrolase/autolysin  26.36 
 
 
529 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000116689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
948 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.7 
 
 
529 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  27.52 
 
 
451 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.46 
 
 
540 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  25.47 
 
 
413 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.26 
 
 
476 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  28.33 
 
 
535 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  28.33 
 
 
535 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0368  cell wall hydrolase/autolysin  23.98 
 
 
474 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000387898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.53 
 
 
414 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 
352 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3748  cell wall hydrolase/autolysin  27.36 
 
 
237 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  30.21 
 
 
876 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.86 
 
 
257 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  25.85 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  34.44 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>