13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2505 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2505  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 459 aa  892    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1835  polysaccharide biosynthesis protein  57.68 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2510  polysaccharide biosynthesis protein  38.15 
 
 		 468 aa  290  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.93 
 
 		 517 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  31.62 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.76 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.19 
 
 		 488 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>