25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2087 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  63.3 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 407 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 392 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  31.72 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.98 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 249 aa  89.7  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  25.66 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  24.66 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  24.22 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  31.96 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  22.31 
 
 		 339 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  22.48 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  24.14 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1160  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.276403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>