23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1409 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  100 
 
 		 63 aa  130  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  68.85 
 
 		 61 aa  89.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  73.81 
 
 		 53 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0307  30S ribosomal protein S27ae  50.88 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  46.55 
 
 		 72 aa  60.1  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1439  30S ribosomal protein S27ae  53.19 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143356  normal  0.0246372 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  47.37 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1894  30S ribosomal protein S27ae  52.17 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  56.52 
 
 		 57 aa  52  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  52.17 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  53.33 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  45 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  50 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  50 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  48.89 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  45.83 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  45.83 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  48.94 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  42.62 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  47.73 
 
 		 51 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  43.75 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  43.48 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  39.66 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>