20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2181 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  44.5 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  30.11 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  25.89 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  37.62 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  31.53 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  28.85 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  31.63 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  32.29 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  29.29 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  29.27 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  28.44 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  21.31 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  21.93 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  41.51 
 
 		 285 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3025  hypothetical protein  27.96 
 
 		 178 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  23.58 
 
 		 165 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2883  hypothetical protein  27.96 
 
 		 238 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  41.51 
 
 		 284 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>