More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1377 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1377  esterase/lipase-like protein  100 
 
 
341 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 
298 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.11 
 
 
372 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0843  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.46 
 
 
370 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.98 
 
 
299 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1026  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.02 
 
 
423 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5278  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.65 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.71 
 
 
309 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.79 
 
 
310 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3228  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.88 
 
 
331 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.3 
 
 
301 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.38 
 
 
302 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0557  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.75 
 
 
355 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.97 
 
 
321 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.13 
 
 
299 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.17 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.25 
 
 
326 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.47 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.17 
 
 
320 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.48 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  33.04 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  33.05 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  33.05 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  33.05 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  33.05 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  33.05 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  33.05 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  33.05 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3615  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.25 
 
 
331 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03568  esterase  35.02 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.16 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  31.28 
 
 
318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1479  esterase/lipase/thioesterase  41 
 
 
342 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.21 
 
 
341 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.74 
 
 
320 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  32.17 
 
 
320 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.62 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.44 
 
 
318 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.8 
 
 
298 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.62 
 
 
297 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.17 
 
 
320 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.2 
 
 
325 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.2 
 
 
298 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.38 
 
 
296 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5853  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.7 
 
 
338 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  30.95 
 
 
308 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.74 
 
 
320 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.74 
 
 
320 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.88 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.62 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1039  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.62 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0939245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3232  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.43 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.53 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.83 
 
 
296 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1285  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.82 
 
 
378 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0279465  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.98 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.98 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13101  acetyl-hydrolase/esterase lipR  33.05 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.03 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.8 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0489  Alpha/beta hydrolase  30.53 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0084  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.3 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04570  conserved hypothetical protein  33.76 
 
 
746 aa  113  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.28 
 
 
304 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.28 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.88 
 
 
308 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.48 
 
 
335 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  33.33 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  32.05 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.84 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.84 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  29.41 
 
 
297 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.95 
 
 
300 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.55 
 
 
272 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.95 
 
 
305 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
328 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.57 
 
 
347 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.64 
 
 
318 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.64 
 
 
318 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.64 
 
 
318 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  33.33 
 
 
326 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.78 
 
 
323 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.47 
 
 
303 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.47 
 
 
314 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.06 
 
 
303 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  31.88 
 
 
303 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  28.32 
 
 
317 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.62 
 
 
303 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 
303 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  28.74 
 
 
304 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0616  esterase, putative  33.33 
 
 
303 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4007  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.63 
 
 
306 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.47 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  27.47 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.62 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.19 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>