32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0833 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  72.16 
 
 		 481 aa  685    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  75.16 
 
 		 472 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  71.95 
 
 		 481 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  71.77 
 
 		 474 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  69.98 
 
 		 473 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  71.4 
 
 		 474 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  71.46 
 
 		 474 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  82.77 
 
 		 474 aa  794    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  71.73 
 
 		 481 aa  679    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  71.95 
 
 		 481 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  73.26 
 
 		 475 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  72.92 
 
 		 474 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  967    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  69.98 
 
 		 461 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  58.52 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  41.4 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  41.39 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  39.07 
 
 		 417 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  41.97 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  39.6 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  40.33 
 
 		 443 aa  246  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  33.68 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  31.39 
 
 		 409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  31.73 
 
 		 382 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  24.38 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.13 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  19.76 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  19.32 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.65 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  28.82 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.18 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1017  Cytochrome c biogenesis protein-like protein  21.69 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>