143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0582 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
165 aa  336  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0137231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
169 aa  183  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  49.67 
 
 
159 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  46.25 
 
 
165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  46.25 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  46.25 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  44.16 
 
 
157 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
177 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3487  GCN5-related N-acetyltransferase  42.51 
 
 
174 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  43.56 
 
 
170 aa  133  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0877  acetyltransferase  42.42 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  40.72 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.881941  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
170 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.623177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3125  GCN5-related N-acetyltransferase  41.82 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0061391  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0875  GCN5-related N-acetyltransferase  40.72 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183729  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  85.29 
 
 
72 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.573636  normal  0.133942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3423  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.679599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000283467  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  35.61 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  27.95 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
160 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  28.79 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  30 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  25.95 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
184 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  25.79 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
298 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14323  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
167 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0781  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
164 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 
154 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  25.28 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972339  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6333  acetyltransferase  25.49 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  25.38 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  27.69 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  25.78 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  25.78 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  25.78 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  24.44 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  29.05 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1930  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525718  hitchhiker  0.000000154732 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.19 
 
 
146 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  27.48 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  26.56 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  27.27 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  26.56 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3933  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  22.5 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3035  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6142  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.189087  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1659  hypothetical protein  25.47 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  30.65 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
119 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.43 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  33 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1864  acetyltransferase, GNAT family  29.81 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.96 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  25.95 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0123  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
237 aa  44.3  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202356  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  22.44 
 
 
156 aa  44.3  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  25.38 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0105  acetyltransferase  28.3 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25620  acetyltransferase  28.08 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2793  amino-acid N-acetyltransferase  25.95 
 
 
447 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.44 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  23.35 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>