26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0300 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0300  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.526275  hitchhiker  0.000000110588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3911  hypothetical protein  92.49 
 
 		 215 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4620  hypothetical protein  87.38 
 
 		 215 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0318  hypothetical protein  86.85 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0312  hypothetical protein  86.85 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0313  hypothetical protein  86.85 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0317  hypothetical protein  86.38 
 
 		 217 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3710  hypothetical protein  85.45 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.147612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0309  hypothetical protein  85.45 
 
 		 217 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4403  hypothetical protein  84.04 
 
 		 222 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0314  hypothetical protein  84.98 
 
 		 217 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3547  hypothetical protein  81.86 
 
 		 216 aa  374  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.870565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0329  hypothetical protein  83.57 
 
 		 215 aa  351  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.14271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3406  hypothetical protein  84.18 
 
 		 217 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3450  hypothetical protein  72.64 
 
 		 215 aa  315  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3953  hypothetical protein  61.32 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001901  hypothetical protein  61.17 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03527  glutamine synthetase  58.57 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000263621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00592  hypothetical protein  61.29 
 
 		 189 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1412  hypothetical protein  48.73 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2063  hypothetical protein  43.27 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0236211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0761  hypothetical protein  44.5 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000010491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15390  hypothetical protein  45.67 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0448469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0988  DNA repair ATPase  47.47 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  hitchhiker  0.00727028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0520  hypothetical protein  43.93 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2822  hypothetical protein  26.57 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>