24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3668 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  310  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  46.72 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  39.69 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  42.74 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  42.98 
 
 
188 aa  92  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  43.9 
 
 
128 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  40.8 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  45.04 
 
 
141 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  39.1 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  42.62 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  34.97 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  35.45 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  36.36 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  31.62 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  66.67 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  64.52 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  31.45 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2100  hypothetical protein  64.29 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  29.91 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1416  hypothetical protein  45.95 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  64.29 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  28.42 
 
 
541 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  28.42 
 
 
541 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>