10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3078 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3078  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635173  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2373  hypothetical protein  34.73 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  21.77 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2370  hypothetical protein  27.88 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.27 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.63 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  28.3 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.75 
 
 		 245 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>