28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1511 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1511  Phage shock protein A (IM30) suppresses sigma54- dependent transcription-like protein  100 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4258  phage shock protein A, PspA  52.89 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0897975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2398  phage shock protein A, PspA  52.46 
 
 		 272 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3987  phage shock protein A, PspA  53.14 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2126  phage shock protein A, PspA  52.87 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2172  phage shock protein A, PspA  52.87 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2113  phage shock protein A, PspA  52.87 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0465583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  53.36 
 
 		 291 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5796  phage shock protein A, PspA  52.94 
 
 		 288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2199  PspA/IM30 family protein  55.74 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  53.36 
 
 		 290 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4000  phage shock protein A, PspA  52.42 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381364  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25130  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  53.25 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12757  35 kDa alanine rich protein  52.87 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000120409  normal  0.0964679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3927  phage shock protein A, PspA  51.25 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1778  phage shock protein A, PspA  53.14 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3535  phage shock protein A, PspA  51.52 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1210  phage shock protein A, PspA  51.95 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00601688  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  25.45 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5275  hypothetical protein  47.69 
 
 		 106 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  24.67 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3332  hypothetical protein  49.09 
 
 		 81 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0736774  normal  0.445072 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4072  phage shock protein A, PspA  26.61 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3546  hypothetical protein  42.42 
 
 		 98 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3000  hypothetical protein  52.5 
 
 		 91 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267526  normal  0.0288437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11655  hypothetical protein  44.83 
 
 		 85 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.536656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2468  phage shock protein A, PspA  24.07 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000346263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2111  hypothetical protein  45.95 
 
 		 113 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>