42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1225 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8261  hypothetical protein  54.64 
 
 		 200 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0410012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6038  hypothetical protein  47.25 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  42.11 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  42.03 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  34.03 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  32.12 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  24.21 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  23.16 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4849  hypothetical protein  26.04 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  34.38 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  27.03 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  30.94 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  29.26 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14500  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  39.66 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.111122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  31.4 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  23.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  23.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  23.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  23.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  48.78 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  39.68 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  30.88 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  30 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7176  protein of unknown function DUF1470  27.45 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  31.34 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  39.06 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  37.65 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4842  protein of unknown function DUF1470  37.61 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  35.09 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0917  protein of unknown function DUF1470  25.54 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.782251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  35.09 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  37.97 
 
 		 200 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1178  hypothetical protein  27.22 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  37.1 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  33.9 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3480  protein of unknown function DUF1470  27.81 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>