19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1194 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  180  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7012  hypothetical protein  60.26 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  49.32 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2949  hypothetical protein  51.61 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0071844  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  43.06 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  35.62 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3280  hypothetical protein  42.67 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3186  hypothetical protein  39.02 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  38.16 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  35.53 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  29.55 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  31.33 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  29.55 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  34.72 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  35.53 
 
 
87 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  26.03 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  35.53 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2047  hypothetical protein  29.85 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>