27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0915 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  239  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  86.67 
 
 
120 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  82.5 
 
 
120 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  76.67 
 
 
146 aa  183  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  73.33 
 
 
120 aa  176  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  77.5 
 
 
129 aa  173  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  75 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  62.18 
 
 
127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  65.83 
 
 
124 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  66.67 
 
 
124 aa  146  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  65 
 
 
118 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  33.04 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  33.64 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  31.53 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  43.33 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  32.14 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  26.42 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  29.06 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  35 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  28.44 
 
 
120 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  31.43 
 
 
271 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  26.17 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  31.43 
 
 
271 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  30.48 
 
 
271 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  28.33 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  27.55 
 
 
272 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>