27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0186 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0186  membrane protein-like protein  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1874  hypothetical protein  37.62 
 
 
244 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  36.33 
 
 
247 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2795  hypothetical protein  35.18 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.400114  normal  0.154233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2852  hypothetical protein  36.3 
 
 
257 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2657  hypothetical protein  43.2 
 
 
248 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000346447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  27.61 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5331  hypothetical protein  30.73 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  32 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  32 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  32 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  27.11 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  32 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1141  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0465994  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4945  hypothetical protein  29.31 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4252  hypothetical protein  31.3 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0626578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  21.68 
 
 
294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1778  hypothetical protein  21.4 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3209  hypothetical protein  32.65 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.673571  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  32.35 
 
 
272 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  28 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4807  hypothetical protein  30.61 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  32.71 
 
 
268 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0713  hypothetical protein  31.53 
 
 
271 aa  46.6  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.102168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3808  hypothetical protein  27.72 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  25.42 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>