31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2708 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  53.25 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  55.96 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  54.92 
 
 		 193 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  61.31 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  56.48 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  48.84 
 
 		 181 aa  148  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  47.67 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  47.7 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  43.65 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  35.8 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  32.47 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  37.18 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  33.72 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  31.93 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  35.93 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  30.38 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  30.13 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  32.93 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  35.85 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  27.27 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  33.14 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  33.56 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  30.08 
 
 		 177 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  33.75 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  32.24 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  23.21 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  28.48 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  31.43 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0641  hypothetical protein  28.21 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0191113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>