15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0641 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0641  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  357  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0191113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  32.9 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  33.91 
 
 
124 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  27.08 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  33.61 
 
 
193 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1486  hypothetical protein  30.72 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  33.61 
 
 
193 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  33.61 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  32.17 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  32.79 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  29.63 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  27.19 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  30.11 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  27.19 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  30.92 
 
 
171 aa  41.6  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>