18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003860 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  74.19 
 
 
171 aa  176  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0641  hypothetical protein  33.91 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0191113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  32.76 
 
 
190 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  30.25 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  33.71 
 
 
217 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  27.1 
 
 
193 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  28.7 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  28.7 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  31.82 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  32.76 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  26.17 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  26.17 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  32.97 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  31.18 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  39.47 
 
 
171 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  26.32 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>