23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01819 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  74.19 
 
 
124 aa  195  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0641  hypothetical protein  33.12 
 
 
179 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0191113  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  29.59 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  30.3 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  29.91 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  29.49 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  37.11 
 
 
217 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  30.13 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  30.18 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  30.63 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  28.9 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  26.22 
 
 
170 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  31.75 
 
 
196 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  26.61 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  25.69 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  21.6 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  30.57 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  24.77 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3367  hypothetical protein  27.95 
 
 
170 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  31.62 
 
 
163 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1486  hypothetical protein  25.45 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>