32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0817 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  36.48 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  34.36 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  33.12 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  32.67 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  31.95 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  29.7 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  33.75 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  36.54 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  37.75 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  35.9 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  29.7 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  38.68 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  37.09 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  37.74 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  33.95 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  32.28 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  36.94 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  30.26 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  35.21 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  35.9 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  31.45 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  37.09 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  31.52 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3367  hypothetical protein  30.2 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1486  hypothetical protein  33.08 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  33.98 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  30.3 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  25.61 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>