35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1834 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  357  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  38.61 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  38.12 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  38.36 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  34.83 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  29.07 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  34.64 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  33.95 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  30.59 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01776  hypothetical protein  28.66 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  38.22 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  37.01 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  27.84 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  38.22 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  34.42 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  33.54 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  32.76 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1550  hypothetical protein  56.25 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000214674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  32.76 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  32.76 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  31.9 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  30.36 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1953  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  30.64 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  32.73 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  32.89 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  32.69 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  30.63 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  28.3 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  31.19 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  34.15 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  31.21 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  39.26 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>