29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1485 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  316  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  48.12 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3367  hypothetical protein  44.59 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  36.48 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  32.74 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  36.81 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  31.21 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  30.63 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  32.69 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  34.59 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  35.22 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  40.91 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  35.22 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  32.24 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  29.65 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  33.13 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  33.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  36.96 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  31.9 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  40.79 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0641  hypothetical protein  35.62 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0191113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1486  hypothetical protein  38.02 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  37.27 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  41.25 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>