27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0880 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  78.14 
 
 		 247 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  78.14 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  78.14 
 
 		 247 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  77.73 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  65.59 
 
 		 249 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  65.18 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  65.18 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  64.78 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  47.39 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  46.4 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  46 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  28.17 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  25.9 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  29.8 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  27.17 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  26.4 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  42.99 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  25.91 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4049  transcriptional regulator, CadC  22.58 
 
 		 413 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  29.79 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>