15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0688 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0688  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0700399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0657  hypothetical protein  78.95 
 
 
171 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0687  hypothetical protein  77.19 
 
 
175 aa  268  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3698  hypothetical protein  77.78 
 
 
179 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0728  hypothetical protein  61.08 
 
 
167 aa  203  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0502  hypothetical protein  59.43 
 
 
175 aa  197  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3914  hypothetical protein  73.6 
 
 
215 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3638  hypothetical protein  67.5 
 
 
182 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3435  hypothetical protein  40.83 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0751  hypothetical protein  29.53 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1975  hypothetical protein  35.94 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000684  hypothetical protein  33.61 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0965  hypothetical protein  32.33 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.191535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0600  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.57 
 
 
118 aa  44.3  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0941  hypothetical protein  30.37 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0583714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>