21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4456 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2886  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  46.77 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0401  putative transmembrane anti-sigma factor  40.23 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0433  putative transmembrane anti-sigma factor  39.92 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2272  putative transmembrane anti-sigma factor  39.53 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3116  putative transmembrane anti-sigma factor  36.76 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5730  putative transmembrane anti-sigma factor  23.24 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.381936 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6483  putative transmembrane anti-sigma factor  24.56 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  26.44 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  27.95 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.87 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  24.03 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.4 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  26.02 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  28.21 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  20.74 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  22.26 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  26.09 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  26.42 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  26.42 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  24.42 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>