23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4237 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4237  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  994    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0565  hypothetical protein  39.16 
 
 
441 aa  286  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138498  normal  0.211579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4151  hypothetical protein  37 
 
 
440 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4704  hypothetical protein  33.26 
 
 
466 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4655  hypothetical protein  33.33 
 
 
466 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4572  hypothetical protein  33.55 
 
 
466 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3980  putative periplasmic or exported protein  35.59 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4564  hypothetical protein  33.33 
 
 
466 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  33.45 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  31.62 
 
 
449 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3637  hypothetical protein  23.95 
 
 
478 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000800589  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1731  hypothetical protein  26.9 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00571907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4754  Domain of unknown function DUF1996  29.32 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01807  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02100)  27.61 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.504359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3053  hypothetical protein  26.96 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5371  hypothetical protein  27.13 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04570  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
607 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00700  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
1778 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06780  transmembrane receptor, putative  24.91 
 
 
902 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295195  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02000  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 
532 aa  53.9  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08167  conserved hypothetical protein  24.29 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622525  normal  0.47594 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07870  WSC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11970)  20.99 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01570  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 
568 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>