24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3817 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3191  hypothetical protein  56.6 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0988  prepilin peptidase dependent protein-like protein  48.57 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3234  prepilin peptidase dependent protein  48.57 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.568305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1040  prepilin peptidase dependent protein-like protein  48.57 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3392  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  51.33 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.176023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0911  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  51.79 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3010  hypothetical protein  51.82 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3323  hypothetical protein  33.02 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0403449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3143  hypothetical protein  33.02 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3266  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3209  hypothetical protein  32.08 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.13365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3223  hypothetical protein  32.08 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  0.0263221 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3039  hypothetical protein  30.84 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2970  hypothetical protein  29.91 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.254629  normal  0.0125225 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4088  hypothetical protein  29.91 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.198399  normal  0.676509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02671  hypothetical protein  29.91 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.561145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0892  hypothetical protein  29.91 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02632  hypothetical protein  29.91 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2969  hypothetical protein  29.91 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0868  prepilin peptidase-dependent protein C  29.91 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  37.5 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  34.67 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3143  hypothetical protein  29.91 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0860525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>