24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1794 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1794  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  354  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1792  hypothetical protein  80.23 
 
 
177 aa  240  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1793  hypothetical protein  80.23 
 
 
177 aa  234  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21480  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000199316  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21470  hypothetical protein  36.99 
 
 
192 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105143  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1331  hypothetical protein  31.94 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04766  hypothetical protein  33.8 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1511  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.468077  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1510  hypothetical protein  29.48 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1509  hypothetical protein  30.67 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.260399  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0988  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0987  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2702  putative lipoprotein  26.72 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0451  hypothetical protein  27.41 
 
 
261 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0518875  normal  0.837787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0453  hypothetical protein  26.87 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103918  normal  0.212251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1508  hypothetical protein  27.7 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1582  hypothetical protein  28.97 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.781647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1608  hypothetical protein  28.97 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0208  hypothetical protein  26.53 
 
 
208 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3117  hypothetical protein  25.36 
 
 
205 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02033  hypothetical protein  27.88 
 
 
182 aa  44.3  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2700  putative lipoprotein  28.97 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2703  hypothetical protein  39.29 
 
 
247 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02031  hypothetical protein  27.88 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>