46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1842 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  58.54 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  58.25 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  52.36 
 
 		 226 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  50 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  50.89 
 
 		 249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  43.48 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  38.74 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  44.44 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  44.44 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  38.68 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  39.34 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  29.93 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  35.65 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  32.5 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  36.11 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  34.51 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  32.48 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  35.48 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  34.71 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  33.02 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  34.48 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  28.95 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  31.82 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  37.21 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  29.06 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  27.03 
 
 		 316 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  32.14 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  26.28 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  41.82 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  25.9 
 
 		 302 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  34.67 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  30.77 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  40 
 
 		 128 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  35.71 
 
 		 700 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.86 
 
 		 752 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  30.77 
 
 		 269 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  50 
 
 		 272 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  51.35 
 
 		 276 aa  41.6  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  30.3 
 
 		 391 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  30.3 
 
 		 391 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>