22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1221 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  57.69 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3309  hypothetical protein  60.2 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000306941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  45.56 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  41.35 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  41.35 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  45.56 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  45.56 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  45.56 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  41.35 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  41.75 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1238  hypothetical protein  44.3 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0278337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2357  hypothetical protein  42.16 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.532778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  39.08 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  35.62 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  32.95 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4292  hypothetical protein  31.87 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0108  hypothetical protein  31.71 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4432  hypothetical protein  30.86 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  31.68 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3411  hypothetical protein  37.63 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.031686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  35.23 
 
 		 107 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>