28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6096 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6096  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
254 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  64 
 
 
303 aa  284  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.14 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 
144 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  31.93 
 
 
411 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  34.23 
 
 
408 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.4 
 
 
475 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  30.25 
 
 
507 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.43 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  33.06 
 
 
361 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  30.63 
 
 
418 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 
374 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.63 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.03 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.08 
 
 
397 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.96 
 
 
628 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  29.73 
 
 
419 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0685  hypothetical protein  23.95 
 
 
293 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  32.46 
 
 
344 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03640  Ykud domain-containing protein  26.32 
 
 
521 aa  42.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000350594  normal  0.0100407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.06 
 
 
309 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  30.13 
 
 
574 aa  42.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09580  Ykud domain-containing protein  26.77 
 
 
514 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00711473  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.31 
 
 
345 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  22.77 
 
 
386 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2201  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.83 
 
 
116 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 
247 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  28.69 
 
 
347 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>