19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4471 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  320  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  39.5 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  37.8 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  39.47 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.46 
 
 
420 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  39.77 
 
 
421 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  39.13 
 
 
1931 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  32.11 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
479 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  28.03 
 
 
333 aa  57.4  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  29.46 
 
 
301 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  34.09 
 
 
331 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
477 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.79 
 
 
416 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  28.46 
 
 
986 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
398 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  29.03 
 
 
654 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1004  hypothetical protein  29.63 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>