18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3469 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  37.97 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  38.24 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  34.62 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  34.62 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  34.62 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  28.75 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  37.97 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  38.89 
 
 
87 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  29.11 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  35.71 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  35.29 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  39.71 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  39.71 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  27.85 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  34.29 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  33.8 
 
 
82 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>