15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0981 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0981  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  763    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  51.09 
 
 
525 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0639  hypothetical protein  55.28 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  51.88 
 
 
507 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3337  hypothetical protein  53.49 
 
 
729 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154521  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  52.35 
 
 
501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  35.8 
 
 
680 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  35.62 
 
 
724 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 
639 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4166  hypothetical protein  33.17 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00816288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  34.17 
 
 
1829 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1857  pyocin R2_PP, tail length determination protein, putative  44.59 
 
 
814 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  28.79 
 
 
572 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28.92 
 
 
545 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1360  hypothetical protein  37 
 
 
105 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00112374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>