19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0266 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0266  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  326  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  39.84 
 
 
163 aa  101  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1840  hypothetical protein  40.85 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  36.8 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  26.56 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  30.47 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6344  hypothetical protein  31.08 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  30.07 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0246  hypothetical protein  25.83 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3320  hypothetical protein  34.15 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.0554869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  32.76 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0401  hypothetical protein  24.81 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00235213  decreased coverage  0.00197507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  27.64 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  24.22 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1311  hypothetical protein  24.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2076  hypothetical protein  25.81 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  25.6 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  25.6 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0878  hypothetical protein  25.47 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>