20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1840 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1840  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0266  hypothetical protein  40.85 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  43.65 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4756  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120853  hitchhiker  0.00152063 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0092  hypothetical protein  32.87 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0401  hypothetical protein  27.74 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00235213  decreased coverage  0.00197507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4952  hypothetical protein  28.06 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.921168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0485  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3320  hypothetical protein  29.55 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.0554869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7088  hypothetical protein  32.73 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0230  hypothetical protein  32.28 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1147  hypothetical protein  27.48 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000230481  hitchhiker  0.0000000000000469186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0222  hypothetical protein  24.19 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2088  hypothetical protein  26.67 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6975  hypothetical protein  27.13 
 
 		 143 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1411  hypothetical protein  26.27 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.506922  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0246  hypothetical protein  25.95 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3544  hypothetical protein  31.01 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3645  hypothetical protein  26.61 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6380  hypothetical protein  26.61 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219202  normal  0.0893608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>