More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6020 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 88 aa  176  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  75.58 
 
 		 393 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  70.45 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  69.32 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  69.32 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  69.32 
 
 		 88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  68.18 
 
 		 88 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  74.7 
 
 		 97 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  69.32 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  68.18 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  73.49 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  67.05 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 		 100 aa  124  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  70.59 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  70.59 
 
 		 86 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3396  hypothetical protein  67.05 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  62.07 
 
 		 372 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  60.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  60.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  60.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  60.23 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  57.47 
 
 		 370 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  63.64 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3735  transposase IS3/IS911 family protein  61.73 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  62.79 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  65.88 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6139  transposase IS3/IS911 family protein  63.53 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0111  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000238346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0442  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0484  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0898  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1040  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0305091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1078  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1082  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2284  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.884453  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2596  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2688  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2792  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2898  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3007  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3025  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3393  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.452656  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0846  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0991  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1004  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1024  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1055  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1174  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1226  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1307  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.465429  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1377  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1411  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1504  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1513  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018385  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1645  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1759  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1788  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1946  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2074  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1745  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0564  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0579  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000590695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0618  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0686  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0710  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>