20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5494 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  48.77 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  42.95 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0418  hypothetical protein  39.38 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.89745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3123  hypothetical protein  38.24 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0386  hypothetical protein  36.22 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3084  hypothetical protein  40.85 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3200  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5275  hypothetical protein  41.91 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0501  hypothetical protein  31.05 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  32.31 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  37.5 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  35.24 
 
 		 335 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  31.97 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  31.97 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  33.52 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  31.54 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  27.57 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  27.57 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  27.57 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>