27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1596 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  66.08 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  64.68 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  44.95 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  38.43 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  42.99 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  39.37 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  38.86 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  39.91 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  41.36 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  23.44 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  24.48 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  24.48 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  30.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1553  hypothetical protein  22.84 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  26.92 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  23.47 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  34.74 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  28.5 
 
 		 210 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  34.74 
 
 		 234 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>