More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1511 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  70.85 
 
 
273 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  68.25 
 
 
274 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  66.42 
 
 
274 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  62.77 
 
 
274 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  51.35 
 
 
275 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  51.38 
 
 
275 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  48.7 
 
 
275 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  50.99 
 
 
275 aa  265  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  49.25 
 
 
275 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  45.69 
 
 
278 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  48.64 
 
 
285 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  44 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  46.39 
 
 
276 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  40.6 
 
 
275 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  36.29 
 
 
269 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  35.66 
 
 
293 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  39.46 
 
 
276 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  37.12 
 
 
268 aa  155  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  38.58 
 
 
264 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  36.72 
 
 
270 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  36.84 
 
 
272 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  34.85 
 
 
270 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  35.6 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  34.12 
 
 
266 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  28.85 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  31.3 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  31.3 
 
 
275 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  30.88 
 
 
273 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  33.9 
 
 
269 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  31.6 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  31.6 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6576  Inositol-phosphate phosphatase  35.32 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516449  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  32.6 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  31.03 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  31.33 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  34.6 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1992  inositol-1-monophosphatase  35.02 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1876  histidinol-phosphate phosphatase  28.16 
 
 
263 aa  95.5  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1820  inositol monophosphatase  29.49 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1838  inositol monophosphatase  29.27 
 
 
269 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0345  Inositol-phosphate phosphatase  32.11 
 
 
288 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  30.53 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2471  inositol monophosphatase family protein  29.41 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1028  inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.44 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.59391 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6169  Inositol-phosphate phosphatase  34.76 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0197  inositol monophosphatase  28.63 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1407  inositol monophosphatase  31.91 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  31.43 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0043  inositol monophosphatase family protein  29.71 
 
 
258 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.384486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3256  Inositol-phosphate phosphatase  31.98 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0330057  normal  0.162821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0045  inositol monophosphatase family protein  29.71 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  33.8 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0746  inositol-phosphate phosphatase  32.6 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6775  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.33 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2138  histidinol-phosphate phosphatase  28.51 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0673  Inositol-phosphate phosphatase  30.29 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  31.58 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  28.87 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000102923  hitchhiker  0.0000000006834 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2480  histidinol-phosphate phosphatase  27.96 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2665  inositol-phosphate phosphatase  31.8 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.887492  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  31.28 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5608  extragenic suppressor protein SuhB  33.78 
 
 
279 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  30.5 
 
 
266 aa  89  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  31.85 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4282  histidinol-phosphate phosphatase, putative  28.28 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1692  inositol monophosphatase  32.88 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  30 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  30.66 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24310  inositol monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase family protein  32.82 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1389  putative inositol monophosphatase family protein  27.24 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000213319  normal  0.368987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6008  inositol monophosphatase  34.76 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3743  inositol monophosphatase family protein  31.03 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  33.64 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  31.02 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  30.68 
 
 
264 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  30.33 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0644  Inositol-phosphate phosphatase  32.38 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6932  inositol monophosphatase  28.86 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  29.46 
 
 
260 aa  85.5  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1179  inositol monophosphatase family protein  30.05 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3449  inositol-phosphate phosphatase  32.86 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0895511  normal  0.493047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  31.74 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  32.03 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  31.94 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  28.44 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0973  histidinol-phosphate phosphatase  27.03 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1173  Inositol-phosphate phosphatase  32.11 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1141  histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase  26.85 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  30.61 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3784  inositol-phosphate phosphatase  30.52 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000469077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  29.39 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29004  predicted protein  31.3 
 
 
378 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  32.88 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  30.05 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000252692  hitchhiker  0.000000465281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4061  inositol monophosphatase family protein  29.44 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1545  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.35 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  29.76 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0995  inositol monophosphatase  30.95 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.050858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  33.18 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>